题目：三角涡虫酪蛋白激酶2α亚基和丝裂原活化蛋白激酶的cDNA文库克隆及生物信息学分析

三角涡虫（Dujesia japonica）属于扁形动物门涡虫纲，是研究神经生物学、再生生物学以及发育生物学的模式动物。三角涡虫具有独特的再生能力以及形态学的可塑性，所以近年来对涡虫的研究主要集中在再生机制和分子生物学方面，基因组学和功能基因组学等方面的研究将有助于从基因组水平上阐述后生动物再生、发育和进化的机制。
采用Clontech公司CreatorTM SMARTTM cDNA Library Construction Kit技术来构建涡虫的cDNA文库，分别利用RT-PCR和PCR技术对其进行了鉴定，从构建的文库中挑选出部分克隆进行测序并拼接其序列，本实验选择了编码酪蛋白激酶2α和丝裂原活化蛋白激酶的全长cDNA序列，并进行了详细的生物信息学分析，为涡虫功能基因组学的研究提供一定的数据。主要研究结果如下：
丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated proteinkinases，MAPKs)是信号从细胞表面传导到细胞核内部的重要传递者，本实验获得的丝裂原活化蛋白激酶基因的cDNA序列全长约1315 bp，其开放性读码框的长度为1068 bp，编码355个氨基酸。GC含量为38.48%，为亲水性蛋白质，主要位于细胞质中；蛋白分子量约为41359.5kd，理论等电点pI为6.24，蛋白质稳定，不具信号肽，不含跨膜位点；该蛋白属于PKc_like超家族，含有33个活性位点，21个ATP 结合位点，12个底物结合位点，21个KIM停泊位点；相似性及分子进化分析表明，三角涡虫丝裂原活化蛋白激酶MAPK与其他动物的丝裂原活化蛋白激酶MAPK有62﹪～66﹪的相似性，MAPK在不同物种之间如此保守，说明它在生物体内具有非常基础而重要的作用。
酪蛋白激酶2 (casein kinase 2, CK2)是一种高度保守且具有多种生理功能的丝氨酸／苏氨酸激酶，广泛存在于各种真核生物中，该蛋白的α亚基具有独立的细胞功能，很可能起到癌基因的作用。酪蛋白激酶2α的cDNA序列全长2004 bp，包含一个长度为1083bp的开放性读码框，编码360个氨基酸，GC含量为39.27%，为亲水性蛋白质，主要位于细胞质中；蛋白分子量约为41764.2 kd，理论等电点PI为6.43，蛋白不稳定，不具信号肽，不含跨膜位点；该蛋白属于PKc_like超家族，含有26个活性位点，20个ATP 结合位点，11个底物结合位点。相似性及分子进化分析表明，酪蛋白激酶2α与其他物种酪蛋白激酶2α相似性为69﹪～74﹪，说明了CK2的氨基酸序列在进化是高度保守性的。