题目：秦岭地区蠋步甲谱系地理学及群体遗传结构初步研究

秦岭山脉是中国大陆最重要的巨型山脉，从东到西成纬向分布，西起甘肃南部，它以迭山和昆仑山脉分界。向东经过陕西进入河南交界处，延绵一千六百余公里，南北宽数十公里至三百公里不等，面积非常的广大，整个秦岭山脉约12万平方公里。为黄河支流的渭河和长江的支流嘉陵江、汉水的分水岭，最高的主峰是宝鸡市太白县的太白山，海拔3767米。蠋步甲（Dolichus halensis）属鞘翅目，步甲科，蠋步甲属，为秦岭地区的广布种，是研究蠋步甲演化历史较好的地域，也是推测秦岭地区山势形成原因的好材料。本文主要研究蠋步甲种群遗传结构及谱系地理学两个方面，初步研究秦岭地区蠋步甲的演化事件。
此次实验利用mtDNA上的COI序列作为分子标记，针对秦岭地区十三个地理种群共计141个个体进行了研究，结果如下：目标DNA序列总长为685bp, 在测的141个蠋步甲个体中碱基的平均含量是T占36.9%、C占15.1%、A占31.7%、G占16.3%，其中A＋T含量（68.6%）高于G＋C（31.4%）含量。在这685bp的序列中，其中保守位点601个，变异位点84个，变异位点中包括62个简约信息位点及22个单个变异位点。这些变异定义了37个单倍型，单倍型多样性H的平均值是0.898，各个地理种群的单倍型多样性H值的范围从陕西石泉县迎丰镇0.000到湖北郧西县香口乡0.962。核苷酸多样性N的平均值是0.02126，各个地理种群的核苷酸多样性N值的范围从陕西石泉县迎丰镇0.00000到陕西汉中略阳西淮坝0.03566。不同单倍型之间的遗传距离最大的是单倍型hap21和单倍型hap36，它们之间的遗传距离为0.139，最小的接近于0.000（由于变异太小，而软件分析的精细度不够在数值上即表现为0.000）。
基于邻接法（Neighbor joining，NJ）、最大简约法（Maximum parsimongy，MP）、最大似然法（Maximum likelihood，ML）、贝叶斯推论法（BI）构建的单倍型系统发育树分析表明：其全部的单倍型分为两支Ⅰ和Ⅱ，其中第一支又可分为两个小支A和B，利用嵌套进化支序图的结果显示，有两个系统发育关系的嵌套支，结果与系统发育树相同，第一个嵌套支包括了除去陕西石泉县两河镇和陕西石泉县迎丰镇的所有采样点，Hap1被认为是祖先单倍型。在第二个嵌套进化支中包括了甘肃两当灵官殿、甘肃两当杨店乡、陕西汉中略阳县西淮坝、陕西石泉县两河镇、陕西石泉县迎丰镇，Hap30被认为是祖先单倍型。综合嵌套进化支序图和系统发育树结果分析，在实验所采集的采样点内，蠋步甲的发源地应该在甘肃两当杨店乡，起源之后向东扩散，向东扩散过程中在陕南的石泉县迎丰镇和两河镇形成了小的地理组群，经过长时间的瓶颈效应形成了现今当地独有的单倍型分布格局，与其它采样点的遗传距离相距较远。